孢子虫囊素作为黄曲霉毒素的前体出现在真菌的代谢中，因此在结构上是相关的。和黄曲霉毒素一样，孢子虫毒素是由50多种真菌产生的，其中包括曲霉属真菌真菌物种;然而，黄曲霉毒素并不常见。
在谷物和谷物制品以及奶酪、生咖啡和香料等其他产品中都检测到了Sterigmatocystin，即使有关其在食品中存在的数据非常有限。2013年，欧洲食品安全署食物链污染委员会被要求评估食品和动物饲料中含有的茎孢毒素对人类和动物健康的风险。被检查的产品包括:
- 谷物包括小麦，大麦，黑麦，燕麦和大米
- 谷物产品包括面粉，面包和糕点，意大利面，谷物和什锦麦片
- 坚果
- 啤酒
欧洲食品安全局推荐的检出限为1.5 ppb。由于背景噪声，紫外高效液相色谱(UV-HPLC)很难达到如此低的检测水平，LC-MS/MS对奶酪、咖啡和香料等复杂产品的分析也相当困难。因此，为了保证准确的定量，必须使用免疫亲和柱对样品进行纯化和毒素浓度。
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